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Classificação 31ª Rodada - Tabela Completa
| Clube | PG | JG | VI | EM | DE | GP | GC | SG | |
| 1º | Criciúma-SC | 65 | 31 | 20 | 05 | 06 | 66 | 45 | 21 |
| 2º | Goiás-GO | 64 | 31 | 19 | 07 | 05 | 57 | 30 | 27 |
| 3º | Vitória-BA | 63 | 31 | 19 | 06 | 06 | 50 | 33 | 17 |
| 4º | Atlético Paranaense-PR | 58 | 31 | 18 | 04 | 09 | 54 | 32 | 22 |
| 5º | São Caetano-SP | 57 | 31 | 16 | 09 | 06 | 46 | 30 | 16 |
| 6º | Joinville-SC | 52 | 31 | 15 | 07 | 09 | 47 | 29 | 18 |
| 7º | América-MG | 46 | 31 | 15 | 04 | 12 | 50 | 45 | 05 |
| 8º | Avaí-SC | 46 | 31 | 14 | 04 | 13 | 36 | 36 | 00 |
| 9º | Ceará-CE | 45 | 31 | 12 | 09 | 10 | 48 | 44 | 04 |
| 10º | América-RN | 44 | 31 | 12 | 08 | 12 | 45 | 46 | -1 |
| 11º | ASA-AL | 40 | 31 | 12 | 04 | 15 | 41 | 39 | 02 |
| 12º | Paraná-PR | 39 | 31 | 10 | 09 | 12 | 40 | 41 | -1 |
| 13º | Boa Esporte-MG | 38 | 31 | 10 | 08 | 13 | 40 | 47 | -7 |
| 14º | Guarani-SP | 37 | 31 | 09 | 10 | 12 | 29 | 36 | -7 |
| 15º | ABC-RN | 36 | 31 | 09 | 09 | 13 | 38 | 39 | -1 |
| 16º | CRB-AL | 30 | 31 | 08 | 06 | 17 | 36 | 53 | -22 |
| 17º | Guaratinguetá-SP | 28 | 31 | 08 | 04 | 19 | 30 | 53 | -23 |
| 18º | Bragantino-SP | 28 | 31 | 07 | 07 | 17 | 31 | 47 | -16 |
| 19º | Ipatinga-MG | 24 | 31 | 06 | 06 | 19 | 29 | 57 | -28 |
| 20º | Grêmio Barueri-SP | 23 | 31 | 05 | 08 | 18 | 28 | 56 | -28 |
Classificado para a Primeira Divisão
Zona Neutra
Rebaixados para a Terceira Divisão
31ª Rodada
19/10/2012 - 19:30 - Ipatinga-MG 4 x 0 América-RN
19/10/2012 - 19:30 - Grêmio Barueri-SP 2 x 2 São Caetano-SP
19/10/2012 - 19:30 - ASA-AL 3 x 0 Ceará-CE
19/10/2012 - 21:50 - Avaí-SC 1 x 4 Goiás-GO
20/10/2012 - 16:00 - ABC-RN 1 x 0 Bragantino-SP
20/10/2012 - 16:00 - Joinville-SC 3 x 1 CRB-AL
20/10/2012 - 16:00 - Guarani-SP 0 x 3 América-MG
20/10/2012 - 16:00 - Paraná-PR 1 x 1 Criciúma-SC
20/10/2012 - 16:00 - Vitória-BA 0 x 2 Atlético-PR
20/10/2012 - 21:00 - Boa Esporte-MG 0x1 Guaratinguetá-SP