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Classificação 27ª Rodada - Tabela Completa
| Clube | PG | JG | VI | EM | DE | GP | GC | SG | |
| 1º | Vitória-BA | 57 | 27 | 17 | 06 | 04 | 47 | 28 | 19 |
| 2º | Criciúma-SC | 55 | 27 | 17 | 04 | 06 | 57 | 43 | 14 |
| 3º | Goiás-GO | 52 | 27 | 15 | 07 | 05 | 45 | 28 | 17 |
| 4º | São Caetano-SP | 49 | 27 | 14 | 07 | 06 | 41 | 28 | 13 |
| 5º | Joinville-SC | 47 | 27 | 14 | 05 | 08 | 43 | 26 | 17 |
| 6º | Atlético Paranaense-PR | 46 | 27 | 14 | 04 | 09 | 43 | 27 | 16 |
| 7º | Avaí-SC | 43 | 27 | 13 | 04 | 10 | 33 | 28 | 05 |
| 8º | Ceará-CE | 42 | 27 | 11 | 09 | 07 | 43 | 37 | 06 |
| 9º | América-MG | 40 | 27 | 12 | 04 | 11 | 40 | 37 | 03 |
| 10º | América-RN | 40 | 27 | 10 | 07 | 10 | 40 | 34 | 06 |
| 11º | Guarani-SP | 36 | 27 | 09 | 09 | 09 | 28 | 26 | 02 |
| 12º | Paraná-PR | 35 | 27 | 09 | 08 | 10 | 34 | 35 | -1 |
| 13º | Boa Esporte-MG | 34 | 27 | 09 | 07 | 11 | 38 | 41 | -3 |
| 14º | ABC-RN | 33 | 27 | 08 | 09 | 10 | 37 | 35 | 02 |
| 15º | ASA-AL | 31 | 27 | 09 | 04 | 14 | 34 | 37 | -3 |
| 16º | CRB-AL | 28 | 27 | 08 | 04 | 15 | 30 | 49 | -19 |
| 17º | Guaratinguetá-SP | 25 | 27 | 07 | 04 | 16 | 27 | 47 | -21 |
| 18º | Bragantino-SP | 24 | 27 | 06 | 06 | 15 | 27 | 42 | -15 |
| 19º | Grêmio Barueri-SP | 17 | 27 | 04 | 05 | 18 | 21 | 51 | -30 |
| 20º | Ipatinga-MG | 17 | 27 | 04 | 05 | 18 | 24 | 55 | -31 |
Classificado para a Primeira Divisão
Zona Neutra
Rebaixados para a Terceira Divisão
27 ª Rodada
25/09/2012 - 19:30 - ABC-RN 1x1 ASA-AL
25/09/2012 - 21:00 - América-MG 1x2 Grêmio Barueri-SP
25/09/2012 - 21:00 - Joinville-SC 3x0 Boa Esporte-MG
28/09/2012 - 19:30 - Paraná-PR 2x1 São Caetano-SP
28/09/2012 - 21:00 - Guaratinguetá-SP 0x3 Goiás-GO
28/09/2012 - 21:00 - CRB-AL 0x2 Criciúma-SC
29/09/2012 - 16:00 - Avaí-SC 2x0 Vitória-BA
29/09/2012 - 16:00 - Guarani-SP 0x0 América-RN
29/09/2012 - 16:00 - Bragantino-SP 2x1 Atlético-PR
29/09/2012 - 21:00 - Ceará-CE 1x1 Ipatinga-MG