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Classificação 26ª Rodada - Tabela Completa
| Clube | PG | JG | VI | EM | DE | GP | GC | SG | |
| 1º | Vitória-BA | 57 | 26 | 17 | 06 | 03 | 47 | 26 | 21 |
| 2º | Criciúma-SC | 52 | 26 | 16 | 04 | 06 | 55 | 43 | 12 |
| 3º | Goiás-GO | 49 | 26 | 14 | 07 | 05 | 42 | 28 | 14 |
| 4º | São Caetano-SP | 49 | 26 | 14 | 07 | 05 | 40 | 26 | 14 |
| 5º | Atlético Paranaense-PR | 46 | 26 | 14 | 04 | 08 | 42 | 25 | 17 |
| 6º | Joinville-SC | 44 | 26 | 13 | 05 | 08 | 40 | 26 | 14 |
| 7º | Ceará-CE | 41 | 26 | 11 | 08 | 07 | 42 | 36 | 06 |
| 8º | América-MG | 40 | 26 | 12 | 04 | 10 | 39 | 35 | 04 |
| 9º | Avaí-SC | 40 | 26 | 12 | 04 | 10 | 31 | 28 | 03 |
| 10º | América-RN | 39 | 26 | 10 | 06 | 10 | 40 | 34 | 06 |
| 11º | Guarani-SP | 35 | 26 | 09 | 08 | 09 | 28 | 26 | 02 |
| 12º | Boa Esporte-MG | 34 | 26 | 09 | 07 | 10 | 38 | 38 | 00 |
| 13º | ABC-RN | 32 | 26 | 08 | 08 | 10 | 36 | 34 | 02 |
| 14º | Paraná-PR | 32 | 26 | 08 | 08 | 10 | 32 | 34 | -2 |
| 15º | ASA-AL | 30 | 26 | 09 | 03 | 14 | 33 | 36 | -3 |
| 16º | CRB-AL | 28 | 26 | 08 | 04 | 14 | 30 | 47 | -17 |
| 17º | Guaratinguetá-SP | 25 | 26 | 07 | 04 | 15 | 27 | 44 | -18 |
| 18º | Bragantino-SP | 21 | 26 | 05 | 06 | 15 | 25 | 41 | -16 |
| 19º | Ipatinga-MG | 16 | 26 | 04 | 04 | 18 | 23 | 54 | -31 |
| 20º | Grêmio Barueri-SP | 14 | 26 | 03 | 05 | 18 | 19 | 50 | -31 |
Classificado para a Primeira Divisão
Zona Neutra
Rebaixados para a Terceira Divisão
26 ª Rodada
18/09/2012 - Bragantino-SP 2x0 América-MG
21/09/2012 - Avaí-SC 2x0 Guaratinguetá-SP
21/09/2012 - Joinville-SC 3x1 Paraná-PR
21/09/2012 - ABC-RN 3x1 Guarani-SP
22/09/2012 - Grêmio-SP 1x2 Boa Esporte-MG
22/09/2012 - Atlético Paranaense-PR 2x1 Ceará-CE
22/09/2012 - Ipatinga-MG 2x3 Criciúma-SC
22/09/2012 - Vitória-BA 3x1 Goiás-GO
22/09/2012 - São Caetano 3x2 CRB-AL
22/09/2012 - ASA-AL 0x2 América-RN